朱标是太子，而朱允文是正宗的皇长孙，理应继承皇位。朱允文本身并没有什么失德的地方，即使朱标去世，朝中的大臣，也依然是支持，皇长孙继承皇位。如果朱元璋，立朱棣为太子，会造成朝廷的动荡。朱元璋皇子太多。各自有各自的封地，远离朝廷之外。如果立朱棣为太子，其他皇子难免有异心。而且各自手中都有兵马。这一点朱元璋不能不顾及。

朱元璋推翻元朝以后，中国经历了一百多年的异族统治，人心思定，社会的方方面面都需要重新确立规范制度，朱元璋吸取了历史上历朝历代的经验教训用儒家的思想为他的统治做规范，主要是程朱理学的思想。朱元璋建立明朝后，借鉴历朝历代皇室血腥斗争的教训，对明朝的皇位及王位继承制度做出了详细规定，明确了皇位及王位实行嫡长子继承制度，这是我国历史上唯一一个贯彻实行嫡长子继承制度的王朝。

朱元璋有他的苦衷，对他来说，打天下容易，守天下难，他思考的，是如何将朱家的大明传承下去。燕王朱棣能力出众不假，但是他是第四子，他的上面还有秦王和晋王，这两位藩王能力可能不如朱棣，但他们手握军权，话语权很大，还比朱棣更有资历。一旦朱元璋将朱棣立为太子，其他两位藩王必定会心生不满和嫉妒，到时候很有可能会掀起藩王乱战，而这是朱元璋绝对不允许的。

朱棣的母亲很小的时候就被朱元璋赐死了。因为是朱棣的母亲私通出轨，朱元璋一生都一直都在怀疑朱棣到底是不是自己的儿子，可朱棣却是除了太子以外最最优秀的皇子，其他皇子和他相比就是垃圾，太子死后，如果要立别的皇子，朱棣作为最优秀的皇子肯定不服，有更有能力的人不立立个垃圾对谁也说不过去，而立朱棣的话，虽然众人都服，但是只有你知道他极有可能不是自己的儿子，皇室血脉那么重要，你如果是朱元璋，我相信你也会这么做的。